Фамилия Вильгута звучит нехарактерно для русской ономастики — и это первая зацепка. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -а подсказывает, что перед нами, скорее всего, субстантивированное прозвище или фамилия, застывшая в форме именительного падежа. Такое встречается у украинских, белорусских и польских фамилий, а также у фамилий, образованных от личных имён без дополнительного оформления.

Корень Вильгут- явно не славянского происхождения. Самое вероятное объяснение — немецкая основа. В немецком языке есть имя Wilguth или Wilgut, которое восходит к древневерхненемецким элементам willio (воля, желание) и guth (бог, добро). Таким образом, имя могло означать «желающий добра» или «боголюбивый». Вариант написания с «т» (Вильгута) вместо «д» (Вильгуда) — результат оглушения звонкого согласного в произношении, что часто фиксировалось на письме при записи фамилии в русскоязычных документах.

Фамилия могла попасть в восточнославянскую среду через немецких колонистов, ремесленников или военных, которые оседали в Прибалтике, на Волыни или в Галиции. Позже, при переходе в православие или при смешанных браках, фамилия адаптировалась к местной грамматике: мужчины носили Вильгута, женщины — тоже, без склонения по родам. Встречается и вариант Вильгут без окончания, но форма с -а характерна именно для украинской и белорусской традиции, где так оформляли многие заимствованные прозвища.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к мещанам или крестьянам. Дворянских родов с такой фамилией в Российской империи не зафиксировано, хотя отдельные представители могли служить в армии или на гражданской службе. Географически фамилия редкая, встречается точечно на западе Украины, в Беларуси и в приграничных областях Польши. В современной России Вильгута — большая редкость, что делает её ярким маркером миграционных путей предков.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет. Можно вспомнить разве что Вильгельм, но это имя, а не фамилия. Ближайшие аналоги — фамилии на -гута, например, Гута или Гутман, но они имеют другую этимологию. Так что Вильгута стоит особняком: это не переосмысленное славянское прозвище, а прямой след контакта с немецкой культурой, застывший в грамматике восточнославянских языков.