Фамилия Вистунова — женская форма от Вистунов, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. С первого взгляда корень кажется неясным, но если отбросить типичный русский суффикс -ов-, остаётся основа «вистун». Она напрямую связана с глаголом «вистнуть» или «вистеть» — в северных и сибирских говорах это означало свистеть, издавать резкий свист. Человека, который постоянно свистел, свистел громко или делал это по делу и без, могли прозвать Вистуном. Прозвище цепкое и образное: свист на Руси не всегда поощряли (была примета, что свист в доме — к безденежью), но в поле или в лесу свистом перекликались, пасли скот, отпугивали зверя. Так что Вистун — это либо пастух, либо ямщик, либо просто человек с привычкой свистеть.

Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Вистунов — сын Вистуна, то есть потомок того самого свистуна. Модель образования стандартная для русских фамилий второй половины XVI—XVII веков, когда прозвища отцов закреплялись за детьми как фамильное имя. Встречается вариант с -ев (Вистунев), но он редок и мог возникнуть, если основа оканчивалась на мягкий согласный или если в говоре слово произносили как «вистунь».

Однокоренные фамилии — Вистун, Вистюков, Вистюнин, Вистовский — все они держатся вокруг того же звукоподражательного корня. Географически фамилия Вистунов/Вистунова тяготеет к северным областям России: Вологодчина, Архангельская губерния, частично Поволжье. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с таким прозвищем, но массового распространения фамилия не получила — она остаётся довольно редкой.

Вторая, менее вероятная версия выводит фамилию от диалектного «вист» — то же, что «визг», «писк». Тогда Вистун — тот, кто визжит или пищит. Но эта гипотеза слабее, потому что в русских говорах именно форма «свистун» гораздо употребительнее, а «вистун» — её местное фонетическое сжатие. В любом случае, фамилия звуковая, прозвищная, и её носительница в прошлом — потомок человека, которого окрестили за характерный звук, будь то свист, посвист или покрик.