Фамилия Владыченков — это отчество второго порядка, или «двойное» отчество. Цепочка образования проста: в основе лежит прозвище Владыка, от него произошло отчество Владыченко (сын Владыки), а Владыченков — это уже «сын Владыченко», то есть внук Владыки. Такая модель с суффиксом -ов к основе на -енко характерна для восточноукраинских и южнорусских земель, где фамилии на -енко были особенно распространены, а при переходе в великорусскую среду к ним нередко добавляли «великорусский» суффикс -ов.

Что значило само прозвище Владыка? Самый прямой смысл — «властелин», «господин», «тот, кто владеет». В народе так могли назвать властного, строгого человека, который держал дом и семью в крепкой руке. В некоторых говорах слово «владыка» имело и другой оттенок — так говорили о всеми почитаемом, уважаемом человеке, к чьему мнению прислушивались. Обе версии правдоподобны и не противоречат друг другу: прозвище могло закрепиться и за хозяином-самодуром, и за уважаемым старейшиной.

Менее вероятна, но всё же возможна связь с церковным значением слова «владыка» — обращение к епископу, архиерею. В этом случае фамилия могла указывать на принадлежность предка к духовному сословию: либо он сам служил в церкви, либо находился в услужении у архиерея. Однако для фамилий, образованных напрямую от церковных титулов (например, Попов, Дьяконов), чаще использовалась другая модель. Здесь же форма Владыченков говорит скорее о бытовом, народном прозвище, которое давали не по сану, а по характеру или положению в общине.

Фамилия Владыченков — не единственная в этом гнезде. Однокоренные Владыкин, Владыко, Владыченко, Владычнев образованы от той же основы, но по разным словообразовательным моделям. Владыченков выделяется среди них именно своей «длинной» формой, указывающей на внука, а не на прямого сына Владыки.