Фамилия Вохонцев — классический пример «географической» фамилии, образованной по модели «название местности + суффикс принадлежности». Её основа — прозвище Вохонец, которое давали уроженцу определённой местности. Суффикс -ев (в форме Вохонц-ев) указывает на прямое родство: буквально «сын Вохонца».

Прозвище Вохонец восходит к гидрониму Вохонь — реке, притоку Клязьмы. Однако в русской ономастике топонимические прозвища редко образовывали прямо от названия реки — чаще от названия поселения на ней. В данном случае Вохонью, или Вохной, в старину называли не только реку, но и центр Вохонской волости — будущий город Павловский Посад. Первое упоминание этой территории встречается в духовной грамоте Ивана Калиты, а позднее, по преданию, на здешних землях после Куликовской битвы побывал князь Дмитрий Донской. Погост Дмитровский на реке Вохне слился с сельцом Павлово, образовав село Павлово — ядро будущего города.

По переписи конца XVI века в Вохонской волости насчитывалось 119 деревень и 535 крестьянских дворов. Учитывая масштабы волости, прозвище Вохонец было нередким: его мог получить любой выходец из этих мест — и крестьянин, и посадский. Со временем именно эта форма, а не, скажем, Вохнов или Вохнин, закрепилась в фамилии Вохонцев. Суффикс -ец в прозвище типичен для обозначения жителя по названию места («владимирец», «тверяк», «вохонец»), а последующее добавление -ев превратило прозвище в родовое имя.

Таким образом, Вохонцев — фамилия, прямо указывающая на географическое происхождение предка: он был «вохонцем», то есть человеком с реки Вохони или из Вохонской волости, и его потомки унаследовали это имя как родовое.