Фамилия Волхонцев — один из тех случаев, когда географическое название легло в основу родового имени, но не напрямую, а через прозвище. В её основе лежит название реки Волхов. Человек, переехавший с берегов этой реки в другую местность, мог получить прозвище Волховец — «выходец с Волхова». Со временем это прозвище закрепилось за его потомками в форме фамилии на -ев, но с закономерным историческим изменением: звук «в» в корне перешёл в «н» (Волховец → Волхонцев). Такое чередование — не ошибка, а следствие живых фонетических процессов в русских говорах, когда губной звук «в» перед другим согласным мог заменяться на более удобный для произношения носовой «н».

Обратите внимание на суффикс -ев: в фамилиях, образованных от прозвищ на -ец, он встречается реже, чем стандартный -ов. Это указывает на то, что исходное прозвище (Волховец) было не просто указанием на место жительства, а скорее именованием пришлого человека. Таким образом, фамилия Волхонцев недвусмысленно говорит о том, что родоначальник был родом из новгородских или псковских земель, где протекает Волхов. Других версий происхождения, например от личного имени или профессии, для этой фамилии не существует — географическая привязка здесь единственная и наиболее правдоподобная.