Фамилия Волхонина — женская форма от Волхонин, и её основа сразу бросается в глаза: корень «волх-», тот же, что в слове «волхв». Волхвами на Руси называли жрецов, мудрецов, кудесников, людей, обладавших тайным знанием, умевших предсказывать и врачевать. В народной памяти слово сохранило двойственное значение: уважение к мудрости и настороженность к колдовству. Поэтому, скорее всего, фамилия Волхонин — не прямая наследственная от волхвов, а прозвище. Его мог получить человек, которого считали ведуном, знахарем, или же тот, кто вёл себя необычно, загадочно, «по-волховски».

Суффикс «-ин» указывает на модель образования от личного прозвища (Волхоня) или имени, оканчивающегося на -а/-я. Прозвище Волхоня — это уменьшительно-ласкательная или обиходная форма от «волхв». То есть сама фамилия буквально значит «чей?» — сын или потомок Волхони. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где активно бытовали прозвища на -оня, -уня (например, Волхоня, Говоруня, Вертуня).

В ономастике встречается и другая, менее вероятная версия: связь с топонимом Волхонка (урочище, река) или с личным именем Волх (от славянского «волх» — «влажный», «сырой»). Но она слабее, потому что имя Волх (в значении «влажный») практически не зафиксировано в древнерусских источниках, а вот прозвища от «волхв» в среде крестьян и посадских людей — явление известное. Словарь Б. Унбегауна прямо относит такие фамилии к группе, образованной от названий лиц по роду занятий или характерным признакам.

География фамилии Волхонин (и Волхонина) тяготеет к Поволжью и центральным регионам, встречается в Нижегородской, Костромской, Ивановской областях. Это типично крестьянская и мещанская фамилия, без дворянских корней. В сословном плане её носители — скорее всего, потомки государственных или помещичьих крестьян, получивших фамилию в XIX веке при переписях. Прозвище Волхоня могло закрепиться за конкретным человеком в сельской общине, а затем перейти в фамильное имя его детей.

Таким образом, фамилия Волхонина — не про древних жрецов, а про живую народную память о них. Предок носителя фамилии, скорее всего, был не князем и не боярином, а крестьянином или ремесленником, которого в деревне прозвали Волхоней за необычные способности, мудрость или просто за странный, непонятный соседям нрав.