Фамилия Вурганова — одна из тех, где за привычным русским суффиксом скрывается основа, не имеющая славянских корней. Принадлежность к женскому роду выдает окончание -а, а сама фамилия образована от мужской формы Вурганов по стандартной русской модели: к основе фамилии отца добавляется суффикс -ов. Но вот с корнем «Вурган» всё сложнее.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть слово «бурган» или «боркан» — «смерч», «вихрь», «ураган». В русском языке это слово закрепилось как «буран». Переход начального «б» в «в» в диалектах — явление нередкое, особенно при адаптации иноязычного слова на слух. Таким образом, Вурганов могло быть прозвищем человека бурного, стремительного, порывистого, либо же того, кто пережил сильную бурю. В пользу тюркской версии говорит и география: фамилия Вурганов встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири — регионах активного смешения славянского и тюркского населения.

Менее убедительная, но возможная гипотеза — связь с личным именем. В дохристианской Руси существовали редкие имена-обереги, например, Вург или Вурга, но письменных подтверждений этому почти нет. Также не стоит исключать вариант, что Вурганов — это русифицированная форма фамилии из другого языка, например, мордовского или марийского, где похожие звуковые комплексы могли означать «волк» или «медведь». Однако тюркская версия остается основной и наиболее логичной.

В любом случае, фамилия Вурганова не относится к числу распространённых. Её носители, скорее всего, происходят из семей, где в XVI–XVII веках предок получил яркое прозвище, которое затем закрепилось как родовое имя. Сейчас фамилия встречается в основном в России, в том числе среди потомков крестьян и казаков, осваивавших южные и восточные земли.