Фамилия Вышаренко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала доминирующей на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко исторически означал «маленький», «сын» или «ученик», то есть Вышаренко — это буквально «сын Вышаря» или «потомок Вышаря». Ударение в таких фамилиях чаще всего падает на предпоследний слог: Вышаре́нко.

Основа фамилии — прозвище Вышарь. Его происхождение неочевидно, и здесь возможны две версии. Первая связывает корень с древнерусским глаголом «вышарити» — «обыскать», «выведать», «разведать». В говорах «вышарить» означало «вытащить, выгрести, найти шаривши». Такое прозвище мог получить либо дотошный, всё выискивающий человек, либо тот, кто занимался сбором чего-либо (например, вышаривал ульи диких пчёл или собирал подати). Вторая версия менее распространённая: в ряде южнорусских говоров «вышар» — это «выжига», «пройдоха», то есть человек себе на уме. Правдоподобнее первое толкование: прозвища от глаголов действия — типичное явление для украинской антропонимии (ср. Шукайло от «шукати» — искать).

Географически фамилия тяготеет к Полтавщине и Черкасщине, откуда в XIX веке носители переселялись на Кубань и в Ставрополье. В метрических книгах XIX века Вышаренко встречаются в основном среди казачьего сословия и государственных крестьян. Это и понятно: фамилии на -енко в малороссийских губерниях были массовыми у всех слоёв, кроме высшей шляхты.

Редкость фамилии делает её особенно ценной для генеалогического поиска: если вы Вышаренко, то с большой вероятностью все носители этой фамилии — потомки одного человека по мужской линии, получившего прозвище за свою дотошность или хозяйственную сметку. В отличие от распространённых Ивановых или Коваленко, здесь почти нет случайных однофамильцев из разных родов.