Фамилия Вышковский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Вышковский ведет свое начало от топонима Вышков. Такое название носят несколько населенных пунктов: посёлок городского типа в Злынковском районе Брянской области России, село в Ивано-Франковской области Украины и город в Южноморавском крае Чехии. Однако вполне вероятно, что основатель рода Вышковских не был уроженцем одного из этих мест, а просто жил на возвышенности, горе или холме. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Вышковский, со временем получил фамилию Вышковский. О точном месте и времени возникновения фамилии Вышковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Вышковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.