Фамилия Вышковская ведет свое начало от топонима Вышков. Такое название носят несколько населенных пунктов: посёлок городского типа в Злынковском районе Брянской области России, село в Ивано-Франковской области Украины и город в Южноморавском крае Чехии. Однако вполне вероятно, что основатель рода Вышковских не был уроженцем одного из этих мест, а просто жил на возвышенности, горе или холме. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Вышковский, со временем получил фамилию Вышковская.