Фамилия Вышковец — редкий пример, где географическое прозвище застыло в форме, нехарактерной для русской ономастики. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский. Вместо них — суффикс -ец, который в восточнославянских фамилиях обычно указывает на выходца из определённого места. Так, Вышковец — это человек, который родом из населённого пункта с корнем «Вышк-».

Самый очевидный кандидат на роль такого места — Вышков. Это название встречается в нескольких регионах. Есть Вышков в Брянской области (исторически — Новозыбковский уезд Черниговской губернии), есть Вышков в Калужской области, а также деревни с похожими названиями в Беларуси. Но форма «Вышковец» тяготеет к западнорусским и белорусским говорам: в польской и украинской традиции топонимический суффикс -ец как раз и служил для обозначения жителя — «вышковец» буквально значило «житель Вышкова».

Основа «Вышк-» восходит к слову «вышка» — в старом значении это не только башня, но и возвышенность, холм, а иногда и сторожевая вышка. Название села Вышков, скорее всего, дали по расположению на возвышенном месте или по наличию сторожевого пункта. Таким образом, предок носителя фамилии мог получить прозвище по месту жительства: его либо записали как «Вышковец» в документах, либо он сам так назвался, переехав в другую местность.

В отличие от фамилий на -ский, которые часто носили дворяне и духовенство, фамилии на -ец в крестьянской среде были редкостью. Они встречались преимущественно у казаков, мещан и государственных крестьян западных губерний. Вышковец — типично крестьянская или казачья фамилия, закрепившаяся в XIX веке, когда в России окончательно оформились фамилии у непривилегированных сословий. Встретить её можно прежде всего в Брянской области и соседних регионах Беларуси и Украины, а также среди потомков переселенцев в Сибири.

Известных носителей с этой фамилией, вошедших в энциклопедии, нет — это фамилия не «громкая», а бытовая. Но именно такие фамилии лучше всего хранят память о конкретном клочке земли, откуда пошёл род.