Фамилия Вюницкая — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корни, нужно отбросить привычные модели. Фамилия явно имеет польское или западнорусское происхождение, на что указывает суффикс -цк- (чередование с -ск-) и окончание -ая, характерное для женской формы. Мужской вариант — Вюницкий.

Основа фамилии — «Вюн-». Здесь может скрываться либо польское слово «wąski» (узкий), либо его производное — прозвище «Wąs» (ус). В польском языке носовое «ą» при переходе в русскую письменность часто передавалось как «ю» или «у». Так «Wąski» могло превратиться в «Вюнский» или «Вюницкий». Если так, то предок мог получить прозвище за узкое лицо, худобу или, наоборот, за пышные усы (последнее — от «wąs» с суффиксом -ицк-).

Есть и вторая, менее очевидная версия: связь с немецким корнем. Встречаются немецкие фамилии Wünsch, Wunsch (желание, пожелание) или Wünsche. В прибалтийских губерниях, где жили немцы и поляки, такие фамилии могли русифицироваться, получив окончание -ский/-цкий. Но это предположение слабее, так как звуковой переход «sch» → «юн» нехарактерен для русского языка.

Географически фамилия Вюницкая тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — современной Беларуси, западной Украине, а также к Польше. Встречается она и в еврейской среде, но там, скорее всего, это искусственный вариант от названия местечка (топонимическая фамилия). В любом случае, носительницы фамилии Вюницкая — потомки людей, живших на стыке славянских культур, где польское влияние смешивалось с русским, а прозвища давали по внешности или месту жительства.