Фамилия Яфонкина — редкий случай, когда корень слова почти полностью стёрт, а сохранившийся суффикс и региональная привязка говорят больше, чем само прозвище. Это женская форма фамилии Яфонкин, которая образована по стандартной русской модели: основа + суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей сын?» — Яфонкин). Мужская версия, Яфонкин, зафиксирована в основном в Поволжье, особенно в Самарской области и Татарстане, что сразу задаёт направление поиска.

Корень «Яфонк-» — тёмный. Самое правдоподобное объяснение лежит в диалектной фонетике: это искажённое «Ефим» или «Афоня». В русских говорах начальное «я» вместо «е» или «а» не редкость (сравните: «Ягор» вместо «Егор»). Если взять уменьшительную форму «Афонька» (от Афанасий), то при переходе «а» в «я» и добавлении суффикса -ин получаем Яфонькин, а со временем «ь» мог выпасть, дав современное Яфонкин. Так что предок носительницы фамилии с большой вероятностью был Афанасием, которого в деревне звали Яфонькой.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть слово «яфан» (или «яфанк» в диалектах) со значением «покрывало», «накидка». Прозвище Яфонка могли дать торговцу тканями или человеку, носившему заметный плащ. Однако эта гипотеза слабее: фамилия Яфонкин не встречается у татар в качестве распространённой, а суффикс -ин — исконно русский, что говорит о славянской адаптации.

Обратите внимание на суффикс -к- в основе. Он типичен для кратких, обиходных форм имён (как Тимошка, Ивашка). Это значит, что фамилия не дворянская и не книжная — она родилась в крестьянской или мещанской среде, где людей называли по отцу с пренебрежительно-ласкательным оттенком. Сословно фамилия почти наверняка принадлежала государственным или помещичьим крестьянам, а не духовенству или купечеству.

Итог простой: Яфонкина — это «дочь Яфонки», то есть потомок человека по имени Афанасий, которого в быту звали Яфонькой. Фамилия редкая, географически привязана к Самарскому Заволжью, и вряд ли имеет отношение к знаменитым родам или историческим событиям.