Фамилия Ягнышев образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Ягнышев образована от прозвища Ягныш. Скорее всего, в его основе лежит украинское слово «ягня» - «детеныш овцы». Возможно, так называли кудрявого человек. Однако нередко подобное прозвище закреплялось за покорным, пугливым человеком. Согласно другой версии, Ягныш — это одна из форм белорусского имени Ягiнт. Оно, в свою очередь, является аналогом литовского имени Гинтовт (от слов ginti - «оборонять» и tauta «народ»). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ягныш, со временем получил фамилию Ягнышев. О точном месте и времени возникновения фамилии Ягнышев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ягнышев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.