Фамилия Янышев образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Янышев послужило церковное имя Иоанн. Фамилия Янышев восходит к распространенному на западно-христианскому имени Ян. Оно является польским вариантом крестильного мужского имени Иоанн (в переводе с древнееврейского – «милость Божия»). Покровителями этого имени считаются несколько святых: преподобный Иоанн Лествичник, автор книги «Лествица», в которой он указал тридцать добродетелей, ведущих человека на небо, к блаженству; Иоанн Предтеча, или Креститель, сподобившийся крестить Иисуса и своими проповедями предвосхитивший христианство; а также святой апостол и евангелист Иоанн Богослов, ученик Спасителя и свидетель важнейших дел и событий его жизни. Веселовского записаны: Яныш Арсений Иванович Муравьев, 1546г.; Яныш Нарышкин, 1565 г.; Яныш Нармацкий, 1565 г. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ян, со временем получил фамилию Янышев. О точном месте и времени возникновения фамилии Янышев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Янышев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.