Фамилия Яхтин образована от прозвища Яхта, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «потешное, мореходное, небольшое судно». Можно предположить, что предок обладателя фамилии Яхтин занимался изготовлением морских суден. Кроме того, Яхтой могли прозвать и моряка. Согласно другой версии, прозвище Яхта связано с существительным «яхташ», что означает «охотничья сумка для дичи». В этом случае прозвище Яхта мог получить охотник. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Яхта, со временем получил фамилию Яхтин.