Фамилия Якимовец образована по модели, характерной для западнорусских и украинских земель. В основе лежит каноническое имя Иоаким (в бытовом произношении Яким), которое имеет древнееврейское происхождение и переводится как «поставленный Богом» или «Бог воздвигает». К имени добавили суффикс -овец, указывающий на принадлежность или происхождение: буквально Якимовец — это «сын Якима» или «потомок Якима». Такая словообразовательная схема с суффиксом -ец встречается в фамилиях преимущественно на территории современной Беларуси, западной Украины и юго-западных областей России, где она конкурировала с более распространёнными на востоке формами на -ов/-ев.

Географически фамилия тяготеет к ареалу, где имя Яким было особенно популярно в XVI–XVII веках. В письменных источниках Якимовцы фиксируются в реестрах казацких полков, в метрических книгах православных и униатских приходов Волыни, Подолья и Галиции. Это позволяет предположить, что предки носителей фамилии были либо крестьянами, либо казаками — именно в этих сословиях отчество, перешедшее в фамилию, закреплялось раньше и устойчивее, чем среди дворянства, предпочитавшего фамилии на -ский.

Редкий суффикс -овец отличает фамилию от более привычных однокоренных вариантов: Якимов, Якимовский, Якименко. Если Якимов — это типичная русская фамилия, Якименко — украинская с патронимическим суффиксом -енко, то Якимовец занимает промежуточное положение. Он характерен для зоны смешения языков и культур, где польское влияние (суффикс -owiec) наложилось на восточнославянскую основу. В польском языке -owiec указывает на сына или владельца, что дополнительно подтверждает западнорусские корни фамилии.

Споров вокруг этимологии почти нет: имя Яким общеизвестно, суффикс прозрачен. Единственная альтернативная версия — связь с топонимом (например, село Якимовцы на Хмельниччине), но в таком случае фамилия означала бы «выходец из Якимовцев», а не «сын Якима». Однако для большинства носителей фамилии более вероятно патронимическое происхождение, так как массовое закрепление фамилий по месту жительства происходило позже и в меньших масштабах.

В современных базах данных фамилия встречается нечасто, но стабильно: её носители живут в России (преимущественно в Брянской и Смоленской областях), в Беларуси и на западе Украины. Написание закрепилось с буквой Ё только в единичных случаях, обычно пишут через Е. Фамилия не имеет дворянского герба и не фигурирует в родословных книгах Российской империи — это верный признак её простонародного, крестьянского или казацкого происхождения.