Фамилия Якимсев — один из тех случаев, когда на слух слышится одно, а на письме закреплено другое. В основе лежит каноническое имя Иоаким, которое в народной русской традиции превратилось в Яким. Это сокращённая, обиходная форма, характерная для северных и центральных говоров, где «аканье» и перестановка звуков давали такие варианты. Казалось бы, логично было бы получить фамилию Якимов, но здесь сработала редкая модель.

Ключевая особенность — суффикс -сев. Он возник не сам по себе, а в результате фонетического слияния. Исходная форма отчества была Якимец или Якимечев, где основа заканчивалась на мягкий согласный. При переходе в фамилию на -ев произошло упрощение: сочетание «мец» или «меч» со временем стянулось в «мс». Так Якимецев превратился в Якимсева. Подобное явление встречается у фамилий вроде Ефимсев (от Ефимец) или Кузьминсев, но для Якимсева оно особенно показательно: без понимания этого сдвига корень кажется тёмным.

По географии фамилия тяготеет к Верхневолжью и северо-востоку. Наибольшая концентрация носителей исторически фиксируется в бывших Ярославской и Костромской губерниях, где имя Яким было особенно популярно среди крестьянского и посадского населения. Предок Якимсева — скорее всего, не дворянин, а человек из среды, где отчество образовывали от уличного, бытового имени, а не от полного церковного.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Якимец — так могли называть выходца из села или деревни с названием Якимово, Якимцево или Якимец. Таких топонимов немало на севере. Но и в этом случае суффикс -сев остаётся тем же следом фонетического сжатия, что делает фамилию уникальной по механизму образования: она не просто «сын Якима», а «сын того, кого звали Якимец».