Основой фамилии Якимшина послужило церковное имя Якимша. Имя Якимша, которое легло в основу фамилии Якимшин, представляет собой обиходный вариант мужского имени Иоаким, которое в переводе с древнееврейского означает «поставленный богом». Скорее всего, основатель рода Якимшиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якимша, со временем получил фамилию Якимшин.