Фамилия Якобенко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, один из самых продуктивных в украинской ономастике, изначально означал «маленький» или «сын такого-то». То есть Якобенко — это буквально «маленький Якоб» или «сын Якоба».

Основа фамилии — личное имя Якоб, западный вариант библейского имени Иаков (в русской традиции — Яков). Имя это древнееврейского происхождения, означает «держащийся за пятку», что в переносном смысле трактовалось как «следующий по пятам» или «вытеснитель». В украинских землях имя бытовало в формах Якiв, Якуб, Якоб, причём последняя форма чаще встречалась на западе, в регионах с сильным польским или немецким влиянием (Галичина, Волынь, Подолье). Таким образом, фамилия Якобенко географически тяготеет к западной и правобережной Украине.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же «сыновних» фамилий от этого имени: Яковенко (от Яков), Якубенко (от Якуб), Якобенко (от Якоб). Разница в одной букве указывает на разный диалектный или заимствованный вариант имени-основы. Встречаются также варианты с ударением на первый или последний слог, что не меняет этимологии.

Интересная деталь: хотя имя Якоб в украинском языке было известно, фамилия Якобенко не входит в число самых массовых украинских фамилий. Это говорит о том, что её носители, скорее всего, происходят из относительно компактного региона, где форма «Якоб» была привычнее, чем «Яков» или «Якуб». В польских метрических книгах это имя писали как Jakób, и фамилия могла быть записана именно в таком, полонизированном виде, а затем адаптирована украинским суффиксом.

Сословно фамилия не даёт привязки: на -енко в Украине фамилии носили и крестьяне, и казаки, и мещане. Это просто указание на родство, а не на происхождение из дворянского или духовного сословия. Если ваш предок носил фамилию Якобенко, он, вероятнее всего, был сыном человека по имени Якоб, жившего в западноукраинских землях в XVII–XVIII веках.