Фамилия Якобина звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Она принадлежит к группе фамилий, образованных от библейского имени Иаков (в русской традиции — Яков). Однако её уникальность в том, что в основе лежит не каноническая, а латинская или западноевропейская форма этого имени — Jacobus (Якоб). Фамилия Якобина — это, скорее всего, «матроним», то есть образована от женского имени или прозвища, производного от мужского. Если бы фамилия происходила напрямую от мужчины по имени Якоб, она звучала бы как Якобов или Якобин. Форма с окончанием -а указывает на то, что предком могла быть женщина — жена, вдова или дочь некоего Якоба. В русской традиции такие фамилии часто давали детям, чей отец был известен под прозвищем или именем, а мать играла более заметную роль в хозяйстве или сообществе.

Суффикс -ин в фамилии Якобина типичен для северных и центральных регионов России, где притяжательные фамилии образовывались от основ на -а/-я. Однако сама основа «Якоб» — явно не исконно русская. В Польше, Белоруссии и на западе Украины имя Якуб (Jakub) было распространено повсеместно, и от него образовались фамилии Якубовский, Якубович. Форма Якобина могла возникнуть на стыке культур: например, в среде, где русские суффиксы накладывались на польскую или немецкую основу. Есть и другая версия: фамилия могла быть семинарской — искусственной, данной в духовных училищах. В XIX веке семинаристам часто давали фамилии, образованные от латинизированных имён святых. Якобина могла означать «принадлежащая (церкви) святого Иакова» или быть переделкой фамилии Якоби — в женский род, если речь шла о дочери священника.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных метрических книгах она встречается в западных губерниях — Смоленской, Могилёвской, а также среди польской шляхты, перешедшей в православие. Встречается и вариант Якобина с ударением на второй слог, что указывает на польское произношение (Jakóbina). Известны случаи, когда фамилию давали незаконнорожденным детям, чьим отцом был иностранец или представитель духовенства — так метрики фиксировали происхождение «от Якоба», не называя полного имени отца.

Словообразовательная модель здесь проста, но нестандартна: корень «Якоб» + суффикс -ин + окончание -а. Это не типичная «русская» фамилия, а скорее гибрид, отражающий сложную этническую историю западных окраин империи. Носители фамилии Якобина, скорее всего, происходят из среды, где смешивались православные и католические традиции, а в основе лежит не столько профессия или прозвище, сколько именование по матери или по принадлежности к определённому приходу.