Фамилия Яковченко относится к распространенному типу украино-белорусских фамилий и образована от крестильного имени Иаков. Мужское крестильное имя Иаков в переводе с древнееврейского означает «второй по рождению». В основу фамилии легла производная форма имени — Яковча (Иаков < Яков < Яковча). Поэтому Яковченко буквально понималось как «сын Яковча». Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Яковча можно лишь на основании глубоких и серьезных генеалогических исследований.