Фамилия Якубджанова — яркий пример того, как русская патронимическая модель (суффикс -ов) наложилась на сложное восточное имя. Её основа — мужское имя Якубджан, которое состоит из двух частей: «Якуб» (арабская форма библейского Иакова, означающая «следующий», «идущий по пятам») и «джан» (персидское «душа», «жизнь», в именах — ласковый компонент, вроде «дорогой» или «любимый»). Таким образом, имя Якубджан можно перевести как «Якуб-душа» или «дорогой Якуб», а фамилия Якубджанова — «дочь (или жена) того, кого звали Якубджан».

В русской среде эта фамилия появилась не через прямое наследование от предка-таджика или узбека, а скорее через контакты с народами Средней Азии, где имена с компонентом «джан» чрезвычайно распространены. Судя по окончанию -ова, фамилия женского рода, а её носительница, вероятно, унаследовала её от отца или мужа, который носил фамилию Якубджанов. В самой Средней Азии такие фамилии часто оформлялись без русского суффикса (просто Якубджан), но при переселении в центральные регионы России или при получении паспорта в советское время их русифицировали.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, образованных от простых имён (Иванов, Петров), здесь суффикс присоединился не к основе имени, а к целому составному слову. Это говорит о том, что фамилия складывалась не в крестьянской среде, где прозвища были короткими, а в среде более поздней, городской или смешанной, часто — среди мусульманских народов, принявших русскую модель фамилии в XIX–XX веках. Географически фамилия чаще всего встречается в Таджикистане, Узбекистане, а также среди таджикской и узбекской диаспоры в России.

В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) разбор таких фамилий обычно сводится к констатации восточного происхождения основы. Споров о корне нет: «Якуб» — имя общепризнанное, «джан» — типичный персидский аффикс. Единственная неясность — могла ли фамилия образоваться от прозвища (например, «Якубджан» как ласковое обращение к человеку по имени Якуб), но это маловероятно: в фамилиях такой тип закрепляется только если прозвище стало постоянным, а в данном случае перед нами именно личное имя, ставшее родовым.