Фамилия Якукина — женская форма фамилии Якукин, которая образована по самой распространённой в русской ономастике модели: к основе на -а или -я добавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность. В данном случае основа — Якука, а фамилия буквально означала «сын (или потомок) Якуки». Вопрос в том, что стояло за этим именем или прозвищем.

Скорее всего, в основе лежит уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Яков. В народной речи имя Яков давало множество производных: Якуш, Якуня, Якуха, Якуша и, в том числе, Якука. Суффикс -ук-/-юк- (в слове «Якука» он редуцирован до -ук-) характерен для украинских и южнорусских говоров, где он придавал именам ласкательный или фамильярный оттенок. Таким образом, Якука — это «маленький Яков» или «Яков, которого ласково звали Якукой». Фамилия, соответственно, означает «принадлежащий Якуке».

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с глаголом «якать» — говорить «я», то есть выпячивать себя, хвастаться. В этом случае прозвище Якука мог получить человек с заметным самомнением. Но эта гипотеза слабее, так как в русской антропонимии прозвища от личных имён встречаются гораздо чаще, чем от глаголов с абстрактным значением.

Фамилия Якукин относится к числу довольно редких. Её географическое распространение неширокое: по данным переписей и телефонных справочников, носители фамилии чаще всего встречаются в центральных областях России (Тверская, Московская, Ярославская области) и в Поволжье, что типично для фамилий, образованных от народных форм имени Яков. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли принадлежать и крестьянам, и дворянам, фамилии на -ин в основном были крестьянскими и мещанскими, так как суффикс -ин чаще использовался в среде непривилегированных сословий.

Интересно, что фамилия Якукин — не единственная в своём роде. Есть однокоренные Якушев, Якунин, Якушин, Якубов. Но Якукин стоит особняком: он образован от самой редкой уменьшительной формы — Якука. Это делает фамилию своеобразным маркером: если вы встретили Якукина, скорее всего, его предки жили в местности, где бытовала именно такая, локальная форма имени Яков.