Фамилия Якунчикова — женская форма фамилии Якунчиков, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем Якунча. В основе лежит каноническое имя Иаков (в русском обиходе — Яков), которое в народной речи дало множество уменьшительных и ласкательных форм: Якуня, Якуша, Якутка. Форма с суффиксом -ча (Якунча) характерна для северных и среднерусских говоров, где -ча нередко выступало как экспрессивный вариант суффикса -к-. Таким образом, Якунча — это «маленький Яков» или просто ласковое обращение к человеку по имени Яков.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: основа (Якунч-) + суффикс принадлежности -ов (в мужском роде — Якунчиков). Суффикс -ов указывает на отчество или прозвище отца: «чей?» — Якунчиков, то есть сын Якунчи. В женской форме к основе добавляется окончание -а. Важный нюанс: в разговорной речи XIX века фамилии на -ов/-ев часто произносили с твёрдым [ч], что отразилось в написании — «Якунчикова», а не «Якунчова». Это орфографическая черта, закрепившаяся в документах.

Фамилия редкая и имеет чёткую географическую привязку. По данным переписей и архивов, основные гнёзда Якунчиковых — Тульская, Московская и Рязанская губернии. Самая известная ветвь — купцы Якунчиковы из города Венёва Тульской губернии. Они владели кирпичными заводами и текстильными мануфактурами в XIX веке, а их усадьба в подмосковном Введенском (ныне в черте Звенигорода) сохранилась до наших дней. Однако связь с купечеством не означает, что все носители фамилии происходят из этого сословия: крестьяне и мещане с тем же отчеством тоже могли получить фамилию по имени отца.

С точки зрения социального контекста, фамилия Якунчикова — пример того, как церковное имя в народной переработке дало небанальную, но прозрачную по смыслу фамилию. В отличие от распространённых Яковлевых, форма с суффиксом -ча сохранила отпечаток местного говора и бытовой ласки. Спорных версий у фамилии нет: все исследователи (в том числе Б. Унбегаун в «Русских фамилиях») сходятся на происхождении от уменьшительного от Иаков/Яков.