Фамилия Якунчиков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Якунчиков послужило церковное имя Иаков. Мужское крестильное имя Иаков в переводе с древнееврейского означает «второй по рождению». В основу фамилии легла производная форма имени — Якуня (Иаков < Яков < Якуня). Скорее всего, фамилия Якунчиков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -чик. Со временем, вероятно, род Якунчик переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якуня, со временем получил фамилию Якунчиков. О точном месте и времени возникновения фамилии Якунчиков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Якунчиков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.