По одной из них, эта фамилия образована от мужского имени Яков (в переводе с древнееврейского – «последователь»), точнее от его просторечной формы Якуш. Имя же Яков (каноническая форма – Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Согласно другой, менее правдоподобной версии, основой для фамилии послужило диалектное «якуш» – так в некоторых говорах называли плотника-резчика, который делал украшения на избы и суда. Кроме того, в волжских говорах якушей называли лягушку.