Фамилия Ямакиди образована от слова турецкого происхождения «ямак», которое на русский язык переводится как «помощник, солдат вспомогательных войск, обслуживающих гарнизон крепостей и фортов». Скорее всего, слово «ямак» было заимствовано в период длительного турецкого господства на Балканах. В 1460 году хлынувшие на территорию Византийской империи турки захватили Грецию, которая оставалась под господством Оттоманской империи более трех столетий. На завоеванную территорию Греции турки распространили военную систему. Для охраны крепостей требовались большие по численности гарнизоны. Поэтому очень скоро турки начали приглашать на военную службу греков, взамен оставляя им их прежние земельные участки. Таким образом, можно предположить, что основатель рода Ямакиди состоял на военной службе.