Фамилия Янисова — женская форма фамилии Янисов, и её происхождение связано с редкой для русской ономастики моделью. В русских фамилиях, образованных от полных форм крестильных имён, чаще встречаются суффиксы -ов/-ев или -ин (Иванов, Петров, Ильин). Здесь же основа — Янис, что сразу указывает на нерусский, скорее всего, прибалтийский или западнославянский след. Имя Янис — это латышский вариант имени Иван (Ян), широко распространённый в Латвии и Литве. В русской среде такая форма имени встречалась редко, обычно у обрусевших латышей, эстонцев или поляков, переселившихся во внутренние губернии Российской империи в XIX веке.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе Янис добавили типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Яниса»). Женская форма Янисова, таким образом, означает «дочь или жена Яниса». Суффикс -ов здесь работает как маркер патронимического происхождения, хотя в прибалтийских языках отчества образуются иначе. Это говорит о том, что носители фамилии уже жили в русскоязычной среде, где их имя адаптировали под местные нормы фамилеобразования.

Географически фамилия Янисов/Янисова тяготеет к регионам, где исторически были смешанные русско-прибалтийские контакты: Псковская, Новгородская, Смоленская губернии, а также территории современной Латвии (Латгалия) и Эстонии. В этих местах имя Янис не было экзотикой, и от него могли образовывать фамилии даже местные русские священники или чиновники, фиксируя прозвище или имя пришлого человека.

Вторая, менее вероятная, версия связывает фамилию с греческим именем Янис (вариант Иоаннис), но в русской среде такое имя — редкость, и фамилии от него почти не встречаются. Поэтому прибалтийский след выглядит убедительнее: он объясняет и редкую основу, и модель с суффиксом -ов, которая нехарактерна для исконно русских фамилий от полных форм имён. Сословно предки носителей фамилии могли быть крестьянами или мещанами, переселившимися в русские губернии в ходе аграрных реформ или после присоединения Прибалтики к Российской империи.