Фамилия Янукян образована по армянской модели с патронимическим суффиксом -ян, который означает «принадлежащий» или «из рода». Основа — Янук, уменьшительная форма армянского мужского имени Янус, которое, в свою очередь, восходит к греческому имени Иоанн (Иоаннес), то есть «Иоанн» или «Иван». В армянской традиции имя Янус, а от него и Янук, было распространено как ласкательный вариант, и фамилия на -ян указывает на потомка человека по имени Янук.

В армянской ономастике суффикс -ян (вариант -янц в западных диалектах) — основной способ формирования фамилий, и он не несёт дополнительных сословных значений, в отличие от русских суффиксов -ов или -ин. Янукян — типичная фамилия для восточноармянского ареала (современная Армения, Нагорный Карабах), где такие окончания преобладают. В западных армянских диалектах, распространённых среди диаспоры (например, в Турции до геноцида), мог бы писаться как Янукянц, но в русской передаче закрепился вариант с -ян.

Словообразовательная модель проста: основа Янук + суффикс -ян. При этом само имя Янук в быту могло быть прозвищем или уменьшительным от полного имени, но нередко становилось самостоятельным. Поскольку армянские фамилии часто фиксировали имя отца, предок носителя фамилии Янукян, скорее всего, был человеком с именем Янук, жившим в XVIII–XIX веках, когда фамилии в Армении начали массово закрепляться. О ремесле или социальном статусе по этой фамилии сказать ничего определённого нельзя — она чисто патронимическая, без указания на занятие.

В армянской ономастике фамилия Янукян нередко соседствует с однокоренными: Янукян, Янукянц, а также с вариантами через другие суффиксы, например, Янукян-оглы (в турецкой передаче). Если сравнивать с русскими фамилиями, то по смыслу она близка к Иванову — оба происходят от имени Иоанн, но в армянском варианте через уменьшительную форму. Встречается фамилия нечасто, преимущественно в Армении и в армянских диаспорах России, США, Франции.