Фамилия Яшакин — из числа тех, что хранят в себе уменьшительно-ласкательное имя. В её основе лежит просторечная форма Яшака, которая образована от крестильного имени Иаков (в русской традиции — Яков) с помощью суффикса -ак-. Такие «домашние» варианты (Яша, Яшка, Яшак) были распространены в повседневной речи: суффикс -ак- придавал имени оттенок фамильярности или принадлежности к младшему поколению в семье.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Яшакин буквально означает «сын Яшаки» или «человек из семьи Яшаки». В русских фамилиях суффикс -ин чаще всего крепится к основам на -а/-я, что и произошло: Яшак(а) → Яшакин. По той же схеме возникли фамилии Толмакин (от Толмака), Шуракин (от Шурака) или Васякин (от Васяки).

Интересно, что фамилия эта — преимущественно волжская и южнорусская. По данным региональных справочников, Яшакины встречаются в Пензенской, Саратовской, Ульяновской областях, а также в Мордовии и Татарстане. Это объясняется тем, что в этих краях имя Яков (и его производные) было особенно популярно среди крестьян и мещан.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским корнем «яш» — «молодой», «зелёный», но она натянута: суффикс -ин нехарактерен для тюркских фамилий, а форма Яшакин легко объясняется славянской моделью. Поэтому правдоподобнее всего — происхождение от имени Яков через ласкательное Яшака.

Сословно фамилия неэлитарна: её носители в XIX веке — в основном государственные крестьяне и однодворцы. В метрических книгах середины XIX века по Саратовской губернии встречаются записи о крестьянине Иване Яшакине и его сыновьях, что подтверждает народный, недворянский характер фамилии.