Фамилия Явгареев — редкий пример фамилии, образованной от имени или прозвища с тюркским корнем, но по русской словообразовательной модели. Основа фамилии — «Явгарей» (или «Явгарай»), что представляет собой сложное имя. Первая часть, «яв», восходит к тюркскому «яв» (друг, приятель) или к глагольной основе со значением «быть добрым, милостивым». Вторая часть, «гарей» (или «гарай»), — распространённый тюркский компонент, означающий «власть», «могущество», «сила» (ср. имя Гирей). Таким образом, имя Явгарей могло означать «друг власти» или «милостивый повелитель».

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Явгареев — буквально «сын Явгарея». В русской ономастике фамилии на «-ев» характерны для патронимов от основ на мягкий согласный или «й» (Явгарей → Явгареев). Такая модель стала массовой в XVI–XVII веках, когда крестьян и служилых людей «окрещивали» по отцу, давая фамилию, закреплённую за родом.

География фамилии узкая. Основные носители — потомки татарских мурз или башкирских родов, перешедших на русскую службу. Встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане. В документах XVIII века упоминаются ясачные татары с таким именем — вероятно, предки вели оседлый образ жизни, занимались земледелием или скотоводством.

Отличительная черта фамилии — сочетание редкого тюркского имени с русским окончанием. В отличие от фамилий на «-ов» (Явгаров), где основа оканчивается на твёрдый согласный, вариант Явгареев точнее передаёт исходное имя с конечным «й». Встречаются искажённые написания: Явгареев, Явгаряев, Явгиреев — но первоначальная форма именно с «е» после «р».

Сословно фамилия не привязана к дворянству: большинство Явгареев — крестьяне и казаки. В метрических книгах XIX века их записывали как «государственные крестьяне» или «тептяри» (сословие, близкое к башкирам). Единственная деталь, отличающая эту фамилию от десятка похожих: в некоторых переписях её писали через «а» — Явгараев, что отражает местный диалектный выговор.