Фамилия Юдрина — женская форма фамилии Юдрин, а та образована от мужского личного имени или прозвища Юдра. В русской ономастике это довольно редкий случай: основа не от полного канонического имени, а от краткой или просторечной формы.

Самый прямой путь к происхождению лежит через крестильное имя Иуда. В народном произношении начальное «и» часто отпадало, а «у» смягчалось: Иуда → Юда. Уменьшительно-ласкательный суффикс -р- дал форму Юдра — примерно так же, как Петр → Петра (в значении «маленький Пётр») или Федя → Федра. Имя Иуда в православных святцах есть, но из-за евангельского Иуды Искариота бытовало оно в основном в монашеской среде или у старообрядцев, которые не избегали «неудобных» имён. Однако в крестьянской среде имя могло даваться и без отрицательного оттенка — просто как дань традиции называть по святцам.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: отчество от прозвища Юдра, которое в северных и сибирских говорах означало «непоседа», «ёрш», «вертлявый человек». Слово «юдра» (или «юдрить») фиксируется в архангельских и вятских диалектах в значении «суетиться», «беспокойно двигаться». Если так, то фамилия Юдрин — прозвищная, характеризовавшая поведение предка.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Юдрин, то есть сын Юдры. По модели образования это типичная русская фамилия, возникшая не позднее XVII века, когда отчества на -ин закрепились за потомками людей с именами и прозвищами на -а, -я.

Географически фамилия Юдрин (и Юдрина) тяготеет к северу и северо-востоку России: Вологодская, Архангельская, Кировская области, а также Урал и Сибирь — регионы, куда переселялись старообрядцы и где бытовали диалектные слова. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальное происхождение.

Таким образом, носительница фамилии Юдрина может вести род от человека, которого в крещении назвали Иудой (в народной форме Юдра), либо от прозвищного предка-непоседы. Оба варианта укладываются в живую русскую традицию образования фамилий из просторечных и диалектных форм.