Фамилия Юнаковский — типичный пример польской или западнорусской модели образования через суффикс -ский. В отличие от массовых русских фамилий на -ов/-ев, эта форма указывает на дворянское или шляхетское происхождение, либо на связь с географическим названием. Суффикс -ский прикреплялся к названиям поместий, усадеб или населенных пунктов, и носитель такой фамилии часто был владельцем или уроженцем того места.

Основа фамилии — Юнак. В польском и украинском языках слово «юнак» (junak) означает смельчака, удальца, молодца. В XIX веке это слово активно использовалось в значении «храбрый юноша», «молодой воин». Таким образом, Юнаковский — это либо потомок человека по прозвищу Юнак, либо выходец из населенного пункта с похожим названием. В Польше и на западе современной Украины встречаются топонимы Юнаки, Юнаковка, Юнаковцы — от них и могла образоваться фамилия.

С точки зрения морфологии, фамилия четко делится: корень юнак-, суффикс принадлежности -ов- (указывает на отношение к лицу) и типичный для шляхты суффикс -ский. Двойной суффикс — не редкость: по такой же схеме сложены фамилии Ковалевский (от Коваль), Павловский (от Павел). Важно, что ударение в фамилии падает на третий слог: Юнако́вский, что свойственно польской акцентной норме.

Географически фамилия наиболее распространена на территории бывшей Речи Посполитой — в Западной Украине, Беларуси и восточных воеводствах Польши. В Россию Юнаковские могли попасть после разделов Польши в конце XVIII века, когда шляхта переходила на русскую службу. Встречаются и русские варианты написания — Юнаковский, без смягчения, что подтверждает адаптацию фамилии в православной среде.

Спорных версий происхождения здесь немного. Некоторые исследователи допускают связь с тюркским словом «юнак» (родственник), но это маловероятно: фамилия плотно привязана к славянскому ареалу, и тюркские заимствования в этой форме не фиксируются. Также не стоит путать Юнаковского с фамилией Юнак — последняя проще, без шляхетского суффикса, и чаще встречается у крестьян или казаков.

Таким образом, предки человека с фамилией Юнаковский с высокой вероятностью были либо мелкой шляхтой, владевшей хутором или деревней Юнаки, либо потомками человека, которого за смелость прозвали Юнаком, а его дети и внуки уже оформили фамилию по польскому образцу.