Фамилия Юнчиц — редкий пример фамилии на -иц, которая в русском языке чаще встречается в западных регионах, особенно в Беларуси и на украинском Полесье. Суффикс -иц (или -ицкий) указывает на принадлежность к месту или роду, но в данном случае он мог прикрепиться к основе не топонимической, а личной.

Основа «Юнч-» скорее всего восходит к прозвищу или имени, образованному от корня «юн-» — молодой, юный. В древнерусском языке «юный» означало не только возраст, но и неопытность, свежесть, иногда использовалось как ласкательное прозвище младшего сына или подмастерья. Форма «Юнча» или «Юнчо» могла быть уменьшительным от Юрий, Юлиан или даже от имени Юн (редкое календарное имя, встречавшееся в святцах). Тогда Юнчиц — это «сын Юнчи» или «потомок Юнча», то есть типичная патронимическая модель, но с белорусским суффиксом -иц, который соответствует русскому -ович.

Есть и вторая версия: фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Юнчицы или Юнчичи. Такие топонимы встречаются в исторических документах Великого княжества Литовского, особенно на территории современной Гродненской и Брестской областей. Переселенец из деревни Юнчицы получал прозвище Юнчиц — «тот, кто из Юнчиц». Поскольку фамилия не имеет типичного русского окончания -ов/-ин, её география сужается: основная масса носителей Юнчиц сегодня живёт в Беларуси и среди потомков белорусских эмигрантов.

В польском языке суффикс -ic (аналог -иц) также распространён, поэтому не исключено и польское влияние: фамилия могла писаться как Junczyc или Juncic, а при адаптации в русской среде приобрела привычное окончание -ц. В любом случае, этимология прозрачна: фамилия указывает на молодость предка или его происхождение из места с корнем «юн-».