Фамилия Юницина — женская форма от Юницин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Юница. В основе лежит слово «юница» — так в старину называли молодую женщину, девушку, невестку. В словаре Даля «юница» — это «молодуха, молодица, новобрачная». Фамилия, таким образом, могла указывать на молодую сноху, которая пришла в дом мужа, или на девушку на выданье. Это не ремесленная и не географическая фамилия, а прозвищная, по характерному признаку человека — молодости, свежести, положению в семье.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Юницин, то есть сын или потомок Юницы. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Юни́цина, но в разных говорах могло смещаться. Интересно, что в русской ономастике фамилия Юницин встречается нечасто — она редкая, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска.

Более редкая версия связывает основу с диалектным словом «юн» — молодой, юный. В этом случае Юница — ласкательное прозвище молодого парня или юноши. Но поскольку суффикс -иц- чаще указывает на женский род (ср. «девица», «молодица»), первая версия — от слова «юница» в значении «молодая женщина» — выглядит предпочтительнее. В любом случае, фамилия несёт в себе оттенок молодости, начала жизненного пути.

Фамилия могла закрепиться за крестьянами или мещанами в центральных и северных губерниях России, где диалектное слово «юница» было в ходу. Встречаются отдельные упоминания Юнициных в переписях XIX века по Вологодской и Костромской губерниям. В современной России фамилия остаётся редкой, что облегчает поиск предков — круг носителей узок, и записи в метрических книгах можно отследить по одному региону.