Фамилия Юнова — женская форма, но её основа та же, что и у мужской — Юнов. В русской традиции такие фамилии обычно образовывались от личного имени или прозвища отца с помощью суффикса принадлежности -ов. Если отбросить окончание, остаётся корень Юн-. Тут и начинается самое интересное: у этого корня есть несколько разных источников, и выбрать единственно верный сложно.

Самый прямой путь — от канонического имени Юний. В святцах это имя встречается, хоть и редко. Восходит оно к латинскому Junius — «юношеский», «молодой». В дворянской среде и среди духовенства такие «латинские» имена иногда давали, но Юновы могли быть и из крестьян, если имя дали в честь малоизвестного святого. В этом случае фамилия означала бы «сын Юния», а со временем превратилась в Юнова.

Есть и другая, более бытовая версия. В русских говорах словом «юн» называли молодого бычка или телёнка. Прозвище Юн мог получить либо пастух, либо человек с крутым, упрямым нравом — «бодастый», как молодой бык. От такого прозвища и пошла фамилия. Эта версия выглядит правдоподобнее для большинства современных носителей, так как имя Юний было редкостью, а прозвища от названий животных — массовое явление.

Особенность фамилии — её относительная редкость. Встречается она не повсеместно, а скорее в центральных областях России и в Поволжье. По сравнению с однокоренными, но более частыми Юнкиными или Юниными, фамилия Юнова сохранила более архаичную форму, без уменьшительных суффиксов. Это указывает на то, что её носители, скорее всего, не были выходцами из боярских родов — у знати фамилии чаще оформлялись на -ский. Юновы — это потомки крестьян, ремесленников или служилых людей, чей предок получил прозвище от имени или по характеру.