Фамилия Юоков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд она напоминает искажённое «Юков» или «Еоков», но на деле её корень уходит в финно-угорскую языковую среду, что делает фамилию уникальной для русского ономастикона.

Основа фамилии — слово «юокко» или «йоокко» (фин. joki, карел. jogi — «река», «поток»). В прибалтийско-финских языках этот корень дал множество географических названий и прозвищ. Человек, живший у реки, мог получить прозвище Юокко или Йокка. Русское окончание -ов превратило это прозвище в фамилию по стандартной модели: Юокко → Юоков, то есть «сын того, кого звали Юокко». Суффикс -ов указывает на принадлежность, характерную для великорусских фамилий.

Версия о связи с личным именем Юрий или Юда (через форму Юк) маловероятна: тогда фамилия звучала бы как Юков или Юдин, а форма с двумя «о» и глухим «к» — следствие иного фонетического строя. Географически фамилия тяготеет к северо-западу России: Карелия, Архангельская область, Вологодчина. Именно там столетиями жили карелы и вепсы, чьи прозвища и фамилии на -ов нередко калькировали местные гидронимы.

Сословно Юоковы, скорее всего, происходили из государственных или удельных крестьян, реже — из однодворцев. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована. Встречаемость её крайне низкая: даже в советских телефонных справочниках 1970-х годов Юоковы отмечены единично, преимущественно в Петрозаводске и окрестностях.

Сравнение с близкими фамилиями — Ёков (от ёк — «ледяной наст» в диалектах) или Йоков (от немецкого Joch) — показывает, что Юоков стоит особняком: его основа не славянская и не тюркская, а именно финно-угорская. Это редкий случай, когда русский суффикс -ов прирастает к иноязычному корню, не теряя при этом исходного звучания.