Фамилия Юрчненко — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное имя. На первый взгляд, она похожа на украинские фамилии на -енко, образованные от имени Юрий (Юрко → Юрченко). Но здесь стоит «чн», а не «ч», и это меняет всё.

Самая вероятная версия: фамилия произошла от прозвища Юрчня или Юрчный. В основе лежит диалектный глагол «юрчать» — издавать глухой, урчащий звук, ворчать. В южнорусских и украинских говорах так могли назвать ворчливого, недовольного человека или того, кто постоянно что-то бормочет под нос. Суффикс -енко в таком случае — указание на потомка: «сын Юрчного» или «родом от Юрчного». Это не патроним от крестильного имени, а отчество от прозвища, что встречается реже.

Вторая версия менее правдоподобна, но возможна: искажение при записи фамилии Юрченко. В документах XIX века писарь мог случайно или по привычке записать «Юрчненко» вместо «Юрченко» (под влиянием форм вроде «Иванович» → «Иванов»). Однако, если фамилия закрепилась именно в таком виде у целого рода, это уже не ошибка, а самостоятельное образование.

Географически фамилия тяготеет к юго-западным областям России и востоку Украины — зоне активного бытования фамилий на -енко. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении: возможно, от одного прозвища в одном селе или хуторе.

Социальный контекст типичен для «прозвищных» фамилий: предок носителя не был ни боярином, ни священником, а скорее крестьянином или ремесленником, которого в быту знали по характерной черте — привычке ворчать. Фамилия не перешла в дворянские роды и не фиксируется в старых боярских книгах, что подтверждает её простонародное происхождение.