Фамилия Юзупс — редкий случай, когда славянская модель словообразования накладывается на неславянскую основу. Скорее всего, перед нами латышская или литовская фамилия, русифицированная при помощи суффикса -с. В прибалтийских языках окончание -s — стандартный показатель мужского рода в именительном падеже (как Юзупс, Калныньш, Озолс). Такие фамилии массово фиксировались в документах Российской империи, особенно в Курляндской и Лифляндской губерниях, где русские писцы часто оставляли латышское окончание без изменений или добавляли его к уже адаптированной основе.

Основа фамилии восходит к имени Юзеф (польская и белорусская форма библейского Иосиф). В латышском языке имя Józefs или Juzefs со временем сократилось до Juzups — так возникла фамилия Juzups, а в русской записи — Юзупс. Таким образом, предок носителя этой фамилии, вероятно, был латышом или литовцем, носившим имя Юзеф, либо получил прозвище по отцу («сын Юзефа»). Вариант с окончанием -с указывает, что фамилия оформилась уже на территории Латвии или Литвы, а не в центральной России.

Встречаемость фамилии Юзупс крайне низкая. Если не считать единичных записей в метрических книгах XIX века, сегодня она практически исчезла или трансформировалась в более привычные для русского уха формы — Юзупов или Юсупов. Последняя, кстати, имеет совсем другое происхождение (от тюркского имени Юсуф), и путать их не стоит. Юзупс — это именно балтийский след, который в XX веке, в ходе массовой смены фамилий в Латвийской ССР, могли «обрусить» или упростить.