Фамилия Забулонский — редкий случай, когда географическое прозвище почти наверняка перешло в фамилию с минимальными искажениями. Основа здесь — «за Булоном». Булонь (Boulogne) — не один, а два города во Франции: Булонь-сюр-Мер на берегу Ла-Манша и Булонь-Бийанкур под Парижем. Человек, которого в России или Польше называли «Забулонским», скорее всего, происходил из этих мест либо имел с ними прочную связь — например, служил при посольстве, учился или торговал.

Суффикс -ский типичен для польской и западнорусской шляхетской модели: так образовывали фамилии от названий поместий и городов. Если бы фамилия возникла в великорусской среде, скорее появилось бы Забулонов или Забулонцев. Форма Забулонский выдает польское или украинско-белорусское происхождение носителя — вероятно, предок был шляхтичем герба, получившим прозвание по месту, где долго жил или откуда выехал.

Встречается и альтернативная версия — от прозвища «Забулона», где «булон» могло быть искажением диалектного слова (например, «булда» — глупый человек, или «булыга» — камень). Но она слабая: в русских говорах нет устойчивого корня «булон-» с таким значением. Гораздо правдоподобнее, что фамилия — прямой топонимический след контактов с Западной Европой, возможно, через Великое княжество Литовское, где французские выходцы встречались чаще, чем в Московском царстве.

Сегодня Забулонские встречаются редко, в основном на западе России, в Беларуси и среди потомков польской эмиграции. Фамилия не получила широкого распространения, что подтверждает её узкое, почти камерное происхождение — скорее всего, от одной семьи или одного переселенца, чьё прозвище закрепилось за потомками.