Фамилия Закоморная — редкий случай, когда географический термин стал основой для прозвища, а затем и фамилии. Её ядро — слово «закомора» или «закомара». В древнерусском зодчестве так называли полукруглое завершение стены, напоминающее свод, — элемент, характерный для храмовой архитектуры домонгольской Руси. Но в народной речи слово могло означать и нечто иное: глухой закоулок, нишу, скрытое место за печью или за амбаром. В этом бытовом значении «закомора» — синоним захолустья, укромного угла.

Скорее всего, фамилия Закоморная появилась как прозвище человека, который жил «за коморой» — то есть за хозяйственной постройкой, в отдалении от основного жилья, или же в глухой, малодоступной местности. Женская форма Закоморная указывает на то, что фамилия закрепилась за женщиной или, что чаще, была дана по матери (в случае, если ребёнок рос без отца). Однако в современной русской традиции фамилия Закоморная — это скорее форма женского рода от мужской Закоморный, и носительница фамилии могла унаследовать её от мужа или отца.

Словообразовательная модель — прилагательное с суффиксом -н-, которое перешло в разряд фамилий. Такая модель (Закоморный → Закоморная) типична для южнорусских и украинских территорий, где фамилии на -ый/-ая встречаются чаще, чем в центральной России. Сравните с однокоренными, но более распространёнными фамилиями: Закоморный, Закоморин, Комаров — все они восходят к одному гнезду «комора» (кладовая, клеть, амбар). В украинском языке «комора» — это кладовая, а «закоморок» — чулан. Таким образом, предок носительницы фамилии мог быть не просто жителем окраины, но и, например, ключником или сторожем при амбарах.

География фамилии узкая. Встречается она преимущественно в Курской, Белгородской и Воронежской областях — то есть в зоне исторического расселения, где смешивались великорусские и малорусские говоры. В дореволюционных метрических книгах Закоморные фиксировались как крестьяне и однодворцы. Сословного барьера фамилия не несёт: «закомора» — слово из обихода, а не из дворянского лексикона.

Есть и более смелая, но менее вероятная версия: связь с древнерусским архитектурным термином. Если предок был строителем или реставратором храмов, его могли прозвать Закоморным — по части фасада, которую он возводил. Однако в пользу бытового происхождения говорит то, что профессиональные прозвища по архитектурным деталям в крестьянской среде почти не встречались. Скорее всего, Закоморная — это фамилия о месте, а не о ремесле.