Фамилия Заликина — женская форма, а её мужской вариант, Заликин, образован по одной из самых распространённых в русском языке моделей: с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность, родство: Заликин — буквально «сын Залики» или «человек из семьи Залики». Всё внимание переходит на основу — слово или прозвище «Залика».

Самое правдоподобное объяснение — связь с глаголом «заликать» или диалектным словом «залика». В русских говорах «залика» — это заика, человек с запинками в речи. Суффикс -ик- здесь мог быть уменьшительным или прозвищным: «заика» превратилось в «залика» под влиянием народной этимологии или местного произношения. Прозвища по физическим особенностям давали часто и охотно, и они легко закреплялись в фамилиях, если человек был известен в округе.

Менее вероятная, но допустимая версия — от имени Залик, которое могло быть краткой формой от Залим или Захарий через тюркское влияние. Однако такая гипотеза слабая: для фамилии Заликин нет убедительных параллелей в документах XVI–XVII веков, а вот прозвище «Залика» (заика) встречается в ономастических записях по северным и центральным губерниям.

По географии фамилия редкая, но не единичная. Основные очаги — Вологодская и Архангельская области, что косвенно подтверждает диалектную природу основы: в северных говорах «залика» фиксируется лексикографами. Встречается также в Поволжье, но там могли быть смешанные с тюркскими корнями варианты.

С социальной точки зрения носители фамилии Заликин, скорее всего, происходили из крестьян или посадских людей. Прозвище, данное по речи, не несло оскорбительного оттенка — в деревенской среде такие меткие клички были нормой и передавались детям уже как фамилия. В дворянские роды эта фамилия не попала, что тоже говорит о её простонародном происхождении.