Фамилия Залопупинко — редкий пример, где прозвищная основа, суффикс и ударение вступают в противоречие, из-за чего её происхождение неочевидно даже для подготовленного читателя. Начнём с главного: перед нами украинская модель фамилии на -енко, но с нехарактерным для неё ударением на предпоследний слог (Залопупи́нко, а не Залопупинко́). Это указывает либо на позднюю фиксацию в русской среде (где ударение сместили по аналогии с фамилиями вроде Ива́нко), либо на то, что перед нами не патроним, а прозвище, застывшее в форме субъективной оценки.

Основа фамилии — Залопу́па. В диалектной лексике «лопупа» или «лопупа» (с ударением на второй слог) — это нецензурное, но не матерное обозначение неловкого, рассеянного или простоватого человека, буквально «разиня», «зевака». Приставка за- в восточнославянских прозвищах часто имела усилительное или уничижительное значение: «залопупа» — тот, кто постоянно ведёт себя как лопупа, крайняя степень нерасторопности. Никакой связи с анатомией или «лопухом» (растением) здесь нет — это чисто диалектное слово, зафиксированное, например, в говорах Слобожанщины и Полтавщины.

Суффикс -енко в украинской ономастике — стандартный патронимический (сын такого-то). Но если бы фамилия означала «сын Залопупы», ударение стояло бы на последнем слоге: Залопупе́нко. Наличие ударения на -и- заставляет предполагать, что -енко здесь не патроним, а прозвищный суффикс с оттенком уменьшительности или пренебрежения (как в фамилиях типа Голопупенко, где ударение тоже варьирует). Иными словами, Залопупинко — это не «сын Залопупы», а «тот самый маленький Залопупа» или «этакий Залопупа».

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине — Черниговщине, Полтавщине, Сумщине. В российских переписях XVIII–XIX веков она почти не встречается, что подтверждает её чисто украинское происхождение. Социальный контекст: прозвище давали не «свои» (внутри семьи или общины), а скорее соседи или представители власти (при записи в ревизские сказки). Носитель, скорее всего, был крестьянином или казаком, которого окружающие характеризовали как медлительного или неловкого — без злого умысла, но с насмешкой.

Спорные версии. Иногда основу пытаются связать с «лопух» (растение) или с глаголом «лопупиться» (шелушиться), но это лингвистически слабо: в украинских говорах «лопупа» — именно человек, а не предмет. Версия о тюркском корне (например, от «лап» — хватать) не подтверждается ни фонетикой, ни ареалом. Самая правдоподобная гипотеза — диалектное прозвище, записанное в форме с суффиксом -енко, но с ударением, смещённым под влиянием русского языка или местного говора.

Коротко: фамилия Залопупинко — украинская по модели, диалектная по корню, прозвищная по сути. Предок носителя, скорее всего, был человеком, которого в селе звали Залопупа — не злым и не глупым, но таким, над кем посмеивались из-за нерасторопности.