Фамилия Запердищенко — случай редкий и для неподготовленного уха звучащий почти как курьёз. Однако за неблагозвучной для современного носителя формой стоит обычная восточнославянская модель прозвищного происхождения. Основа здесь — глагол «запердеть» (издать неприятный звук, испортить воздух), который в XVI–XVII веках был не столько грубым ругательством, сколько бытовым, подчас ироничным прозвищем. Человек мог получить его за неосторожность, за привычку, за случай, который запомнился окружающим, — и прозвище закреплялось, теряя обидный смысл и превращаясь в фамильное имя.

Суффикс -енко указывает на украинское или южнорусское происхождение. В этой модели -енко значит «сын» или «потомок»: Запердищенко — буквально «сын Запердища». Форма «Запердищ» (с суффиксом -ищ-) — это либо прозвище, образованное от того же глагола с увеличительным или пренебрежительным оттенком, либо, что вероятнее, вариант прозвища Заперда, Запердь. В украинской антропонимии такие «усиленные» формы на -ищ встречаются: они могли обозначать человека, чем-то выделявшегося в худшую сторону, но без прямой матерной брани.

Родственные фамилии — Запердов, Запердяев, Передищенко, Пердунов — тоже существуют, хоть и редки. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» есть указание, что прозвища от глагола «пердеть» были вполне обычны в крестьянской и казачьей среде, и лишь позже, с изменением речевых норм, стали восприниматься как неприличные. Таким образом, предок носителя фамилии Запердищенко — скорее всего, запорожский или слобожанский казак, крестьянин или мещанин, которому дали прозвище за бытовую черту, не считавшуюся тогда постыдной.

Географически фамилия тяготеет к Украине и югу России. В современных базах данных она встречается единично, что говорит о её редкости и локальном бытовании. Никаких дворянских родов или известных исторических лиц с такой фамилией не зафиксировано — это стопроцентно народная, низовая ономастика. Если вы носите эту фамилию, то держите в руках редкий артефакт прямой и бесхитростной народной словесности, не знавшей цензуры и стеснения.