Фамилия Затонский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Затонский образована от аналогичного прозвища, которое восходит к нарицательному «затон», то есть «часть акватории реки, защищённая от ледохода и течения». Затоны бывают как естественные, например, превратившееся в залив русло старицы, часть акватории, отгороженная от основной акватории косой или речным островом, так и искусственные, отгороженные от основной акватории реки дамбами. Затоны часто используют для зимнего отстоя речных судов, в них же нередко располагают судоремонтные мастерские. Можно предположить, что основатель рода Затонских жил недалеко от затона, за что и получил такое прозвище. Слово «затон» нередко встречается в составе топонимов: на территории России существует около десятка сел с подобным названием. Именно поэтому не следует исключать вероятность того, что предок обладателя фамилии Затонский был уроженцем одного из населенных пунктов с названием Затон. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Затонский, со временем получил фамилию Затонский. О точном месте и времени возникновения фамилии Затонский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Затонский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.