Фамилия Зайнафарова — яркий пример того, как тюркское имя, пройдя через русскую словообразовательную систему, превратилось в привычную для нас фамилию. В её основе лежит мужское имя Зайнафар, которое, в свою очередь, восходит к арабскому составному имени Зайну-ль-Фар (زين الفار). Первая часть «Зайн» означает «украшение», «краса», а «Фар» — это арабизированная форма персидского слова «фарр» (блеск, величие, слава). Таким образом, исходное имя можно перевести как «украшение славы» или «краса величия». Это имя было распространено среди мусульманских народов, и его носитель, скорее всего, был человеком, которому родители желали почёта и высокого положения.

Модель образования фамилии — типично русская, с помощью патронимического суффикса -ов. К основе Зайнафар добавили -ов, получив Зайнафаров, а затем и женскую форму Зайнафарова. Это указывает на то, что фамилия формировалась в русскоязычной среде, вероятнее всего, в среде татарского или башкирского населения, которое массово получало фамилии по такой схеме в XIX — начале XX века. Суффикс -ов здесь работает не как показатель принадлежности к отцу (как в древнерусских фамилиях), а как стандартный грамматический русификатор, «одомашнивающий» иноязычное имя.

Географически фамилия Зайнафарова тяготеет к Волго-Уральскому региону. Её носители — это, в первую очередь, татары и башкиры. Встречаются отдельные случаи у казахов и народов Кавказа, но основной ареал — Республика Татарстан, Башкортостан, а также Оренбургская, Челябинская и Самарская области. Ударение в фамилии, как правило, падает на последний слог: Зайнафаро́ва, что свойственно многим татарским фамилиям, русифицированным через -ов.

Интересная деталь: существует и более редкий вариант написания — Зайнафарова с буквой «а» после «з» (Зайнафарова) или с двойной «ф» (Зайннафарова), но это, скорее, результат орфографических колебаний или ошибок в документах. Основной, устоявшийся вариант — через одну «н» и одну «ф». Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то можно вспомнить Зайнуллин (от имени Зайнулла — «украшение Аллаха») или Зайнашев, но Зайнафарова стоит особняком, так как содержит редкий корень «фар», не связанный с религиозной лексикой напрямую, а отсылающий к древнеперсидским понятиям блеска и царственности.