Фамилия Зебелькина образована от прозвища Зебелька, которое восходит к немецкому слову Zwiebel - «лук, луковица» (от лат. Согласно этому, такое прозвище мог получить человек, который выращивал лук на продажу или просто любил есть лук. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Зебелька, со временем получил фамилию Зебелькина.