Фамилия Зекенова, скорее всего, тюркского происхождения, и её разбор стоит начать с корня, а не с суффикса. Основа «зекен» или «секен» в тюркских языках (особенно в казахском, киргизском, башкирском) может означать «прыгающий», «скачущий», а также быть вариантом слова «секен» — «кузнечик». В переносном смысле такое прозвище могли дать подвижному, непоседливому человеку или тому, кто часто менял место жительства.

Окончание «-ова» указывает на принадлежность к роду. Это стандартный русский суффикс, который присоединялся к тюркским основам при русификации фамилий в XIX–XX веках. Изначальная форма — Зекенов, а Зекенова — женский вариант. Мужская фамилия Зекенов образована по модели «прозвище + -ов», то есть «сын Зекена». Само имя Зекен (или Секен) могло быть не только прозвищем, но и уменьшительной формой от более длинного имени, например, от «Зекенбай» или «Зекенжан», где первая часть восходит к арабскому «зикр» — «поминание» или «память».

С географической привязкой здесь всё прозрачнее, чем у многих фамилий. Фамилия Зекенова распространена в Казахстане и среди казахов, проживающих в России (Оренбургская, Астраханская области). Встречается она и у башкир, но реже. Это позволяет сузить круг поиска: предки носительницы фамилии, скорее всего, были кочевниками или полукочевниками, перешедшими к оседлому образу жизни в период коллективизации или позже. Сословная принадлежность здесь неочевидна: тюркские фамилии на -ов редко указывают на дворянство (если только это не потомки татарских мурз), а чаще фиксируют крестьянское или казачье происхождение.

Интересная деталь: в некоторых диалектах казахского языка «зекен» — это не просто кузнечик, а именно полевой кузнечик, который считается вестником лета. Прозвище могло быть дано человеку, родившемуся в сенокосную пору, или тому, кто славился умением быстро и ловко работать в поле. Таким образом, за фамилией стоит не столько ремесло, сколько характеристика — скорость, подвижность, привязанность к определённому времени года.

Встречаются варианты написания через «с» — Секенова. Это не ошибка, а отражение особенностей произношения в разных тюркских языках. Оба варианта считаются корректными, хотя форма с «з» встречается чаще в документах последних десятилетий.