Фамилия Зекрачева — женская форма фамилии Зекрачев, и её происхождение неочевидно. Это редкая фамилия, которую не встретишь в списках распространённых русских фамилий, и её корни стоит искать не в церковных святцах, а в прозвищах или диалектных словах.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), а основа — предположительно прозвище Зекрак или Зекрач. Такие фамилии обычно возникали в среде крестьянства или посадских людей, когда человека называли по какой-то его характерной черте, занятию или внешности. Суффикс -ев (а не -ин) говорит о том, что основа оканчивалась на согласный или мягкий знак.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом «зекра» или «зикра». В некоторых южнорусских и украинских говорах «зекра» — это искра, огонёк, вспышка. Тогда прозвище Зекрак могли дать человеку с живым, вспыльчивым характером, либо тому, кто работал с огнём (кузнец, угольщик). Фамилия могла писаться и как Зекрачев, и как Зекрачов — в зависимости от местного произношения: в южных регионах «яканье» (зекряк) могло дать форму Зекрячев, но в официальных документах часто закреплялся вариант с буквой «а».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркскими корнями, например, с татарским «зекер» (память, поминание) или «зикр» (религиозная практика). Однако суффикс -ач/яч нехарактерен для тюркских фамилий, которые обычно образуются через -ов/-ев от имён, а не через такой прозвищный формант. Поэтому версия с исконно славянским диалектным словом выглядит убедительнее.

Географически фамилия Зекрачева, судя по скудным данным открытых источников и баз переписей, встречается в основном на юге России, в Ростовской области и Краснодарском крае, а также в некоторых областях Украины. Это совпадает с ареалом бытования слова «зекра» в значении «искра».

Таким образом, предок современных Зекрачевых, скорее всего, был прозван Зекраком за живость нрава или за ремесло, связанное с огнём. Фамилия сохранила редкую диалектную черту и не имеет отношения к дворянским родам или известным историческим личностям — это типичная «народная» фамилия, которая рассказывает о быте и языке той среды, где она возникла.